Tarif tiket kapal Pelabuhan Ferry Penajam atau juga sering disebut Pelabuhan Penajam disesuaikan dengan golongan kendaraan. Untuk penyeberangan Balikpapan ke Penajam dan sebaliknya, tarifnya berbeda, di mana penyeberangan Penajam ke Balikpapan lebih mahal dibandingkan apabila menyeberang dari Balikpapan ke Penajam.(ASDP)